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| Data | Título | Autor(es) | Tipo | Acesso |
| 7-Nov-1994 | Lamas activadas - sistema de mistura completa | Ferreira, Eugénio C.; Mota, M. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2009 | Large scale dynamic model reconstruction for the central carbon metabolism of escherichia coli | Costa, Rafael S.; Machado, C. D.; Rocha, I., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2002 | Levantamento da situação de descarga de águas residuais industriais das empresas sediadas nos Parques Industriais de Adaúfe e Celeirós | Ribeiro, Gabriela; Ferreira, Eugénio C.; Amorim, Cristina, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2019 | Life cycle assessment (cradle-to-gate) of bacterial cellulose production | Forte, Ana Cristina Figueiras; Dourado, Fernando; Gama, F. M., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 28-Abr-2021 | Life cycle assessment of bacterial cellulose production | Forte, Ana Cristina Figueiras; Dourado, Fernando; Mota, André, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2010 | Life cycle assessment of soybean biodiesel and LPG as automotive fuels in Portugal | Morais, Sergio; Mata, Teresa M.; Ferreira, Eugénio C. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 30-Nov-2007 | Literature mining applied to systems biology information retrieval | Lourenço, Anália; Simões, Alberto; Almeida, J. J., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Fev-2021 | Long-term stability of a non-adapted aerobic granular sludge process treating fish canning wastewater associated to EPS producers in the core microbiome | Paulo, Ana M. S.; Amorim, Catarina L.; Costa, Joana Sofia Gomes, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Mar-2019 | Mapping Salmonella typhimurium pathways using ¹³C metabolic flux analysis | Correia, Daniela M.; Sargo, C.; Silva, A., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 1998 | Mass transfer properties of glucose and O2 in Saccharomyces cerevisiae flocs | Vicente, A. A.; Dluhý, M.; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2007 | A mathematical model for a Salmonella bacteriophage | Santos, Sílvio Roberto Branco; Azeredo, Joana; Nicolau, Ana, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Set-2008 | Mathematical modeling of recombinant Escherichia coli aerobic batch fermentations | Costa, Rafael S.; Rocha, I.; Ferreira, Eugénio C. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 5-Out-2000 | Measurement of acetate during the production of recombinant proteins with E. coli | Rocha, I.; Ferreira, Eugénio C. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 8-Jun-2015 | Merlin latest developments for pathways analysis | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 25-Fev-2021 | merlin v4. 0: an updated platform for the reconstruction of high-quality genome-scale metabolic models | Capela, João; Lagoa, D.; Rodrigues, Rúben, et al. | Preprint | Acesso aberto |
| 2020 | merlin v4: an updated platform for reconstructing genome-scale metabolic models | Lima, Diogo Batista; Lagoa, Davide Rafael Santos; Cruz, Fernando João Pereira da, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 24-Jun-2022 | merlin, an improved framework for the reconstruction of high-quality genome-scale metabolic models | Capela, João; Lagoa, Davide Rafael Santos; Rodrigues, Rúben André Costa, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2010 | Merlin: metabolic models reconstruction using genome-scale information | Dias, Oscar; Rocha, Miguel; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2011 | Metabolic footprint analysis of recombinant Escherichia coli strains during fed-batch fermentations | Carneiro, S.; Villas-Bôas, S. G.; Ferreira, Eugénio C., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Set-2009 | Metabolic footprinting of Escherichia coli grown in fed-batch fermentation during recombinant protein production | Carneiro, S.; Villas-Bôas, S. G.; Rocha, I., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
