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| Data | Título | Autor(es) | Tipo | Acesso |
| 2014 | On the effects of phenotype prediction methods over strain design algorithms. A multi-objective approach | Maia, Paulo; Rocha, Miguel; Rocha, I. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Dez-2007 | An ontology-based approach to systems biology literature retrieval and processing | Lourenço, Anália; Simões, Alberto; Almeida, J. J., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Mar-2012 | OPTFERM - a computational platform for the optimization of fermentation processes | Rocha, Orlando; Maia, Paulo; Rocha, I., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2009 | OptFerm - a computational platform for the optimization of fermentation processes | Rocha, Orlando; Maia, Paulo; Rocha, I., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 11-Jul-2013 | OptFlux3: an improved platform for in silico design of cellular factories | Rocha, I.; Vilaça, Paulo; Maia, P., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 27-Jun-2009 | OptFlux: a software for metabolic engineering | Rocha, I.; Maia, Paulo; Pinto, José P., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 22-Mar-2010 | OptFlux: an open-source software platform for in silico metabolic engineering | Rocha, I.; Maia, Paulo; Pinto, José Pedro Basto Gouveia Pereira, et al. | Poster em conferência | Acesso aberto |
| 13-Jun-2010 | Optflux: an open-source software platform for in silico metabolic engineering | Rocha, I.; Maia, Paulo; Evangelista, P., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Abr-2010 | OptFlux: an open-source software platform for in silico metabolic engineering | Rocha, I.; Maia, Paulo; Evangelista, Pedro, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Set-2008 | OptGene: a framework for in silico metabolic engineering | Rocha, I.; Maia, Paulo; Rocha, Miguel, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2012 | Optimization approaches for the in silico discovery of optimal targets for gene over/underexpression | Gonçalves, Emanuel; Pereira, Rui; Rocha, I., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Abr-2007 | Optimization of bacterial strains with variable-sized evolutionary algorithms | Rocha, Miguel; Pinto, José P.; Rocha, I., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2014 | Optimization of fed-batch fermentation processes with bio-inspired algorithms | Rocha, Miguel; Mendes, Rui; Rocha, Orlando, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2016 | Optimizing load balancing routing mechanisms with evolutionary computation | Pereira, Vítor Manuel Sá; Rocha, Miguel; Sousa, Pedro | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2021 | Optimizing NFV deployment in segment routing | Camaz, Gonçalo; Pereira, Vitor; Rocha, Miguel, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| 2017 | Optimizing segment routing using evolutionary computation | Pereira, Vítor; Rocha, Miguel; Sousa, Pedro | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Jul-2017 | OptimModels: a framework for strain optimization using kinetic models | Correia, Sara; Lima, Ana Patrícia Ferreira; Rocha, Miguel, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Mai-2013 | Parallel evolutionary computation in bioinformatics applications | Pinho, Jorge; Sobral, João Luís Ferreira; Rocha, Miguel | Artigo | Acesso restrito UMinho |
| 2002 | Particle Swarms for Feedforward Neural Network Training | Mendes, Rui; Cortez, Paulo; Rocha, Miguel, et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso restrito UMinho |
| 22-Jul-2021 | A pipeline for the reconstruction and evaluation of context-specific human metabolic models at a large-scale | Vieira, José Vítor Castro; Ferreira, Jorge; Rocha, Miguel | Preprint | Acesso aberto |
