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| Data | Título | Autor(es) | Tipo | Acesso |
| Mar-2012 | A generic multi-criterion approach for mutant strain optimization | Maia, Paulo; Rocha, I.; Rocha, Miguel | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2017 | Identification of robust strain designs via tandem pFBA/LMOMA phenotype prediction | Maia, Paulo; Rocha, Isabel Cristina Santos; Rocha, Miguel | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2016 | iFloW: an integrated logistics software system for inbound supply chain traceability | Santos, Nuno António Lira Fernandes Faria; Barbosa, Diogo Jorge Fernandes Serra; Maia, P., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 30-Nov-2009 | Implementing metaheuristic optimization algorithms with JECoLi | Evangelista, Pedro; Maia, Paulo; Rocha, Miguel | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Mar-2016 | In silico constraint-based strain optimization methods: the quest for optimal cell factories | Silva, P.; Rocha, Miguel; Rocha, I. | Artigo | Acesso restrito UMinho |
| 2015 | In silico modular design of Saccharomyces cerevisiae strains for enhanced production of organic acids | Lopes, H.; Maia, Paulo; Patil, Kiran R., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Mar-2020 | MEMOTE for standardized genome-scale metabolic model testing | Lieven, Christian; Beber, Moritz E.; Olivier, Brett G., et al. | Carta ao editor | Acesso aberto |
| 2010 | Metaheuristics for strain optimization using transcriptional information enriched metabolic models | Vilaça, Paulo; Maia, Paulo; Rocha, I., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 27-Jun-2009 | Multi-criterion approaches for the in silico optimization of mutant microorganisms | Maia, Paulo; Ferreira, Eugénio C.; Rocha, Miguel, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2008 | Natural computation meta-heuristics for the in silico optimization of microbial strains | Rocha, Miguel; Maia, Paulo; Mendes, Rui, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Ago-2009 | @Note: a workbench for biomedical text mining | Lourenço, Anália; Carreira, Rafael; Carneiro, S., et al. | Artigo | Acesso aberto |
| 2014 | On the effects of phenotype prediction methods over strain design algorithms. A multi-objective approach | Maia, Paulo; Rocha, Miguel; Rocha, I. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| Mar-2012 | OPTFERM - a computational platform for the optimization of fermentation processes | Rocha, Orlando; Maia, Paulo; Rocha, I., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 2009 | OptFerm - a computational platform for the optimization of fermentation processes | Rocha, Orlando; Maia, Paulo; Rocha, I., et al. | Artigo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 11-Jul-2013 | OptFlux3: an improved platform for in silico design of cellular factories | Rocha, I.; Vilaça, Paulo; Maia, P., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 27-Jun-2009 | OptFlux: a software for metabolic engineering | Rocha, I.; Maia, Paulo; Pinto, José P., et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 22-Mar-2010 | OptFlux: an open-source software platform for in silico metabolic engineering | Rocha, I.; Maia, Paulo; Pinto, José Pedro Basto Gouveia Pereira, et al. | Poster em conferência | Acesso aberto |
| Abr-2010 | OptFlux: an open-source software platform for in silico metabolic engineering | Rocha, I.; Maia, Paulo; Evangelista, Pedro, et al. | Artigo | Acesso aberto |
| Set-2008 | OptGene: a framework for in silico metabolic engineering | Rocha, I.; Maia, Paulo; Rocha, Miguel, et al. | Resumo em ata de conferência | Acesso aberto |
| 19-Mar-2020 | Publisher Correction: MEMOTE for standardized genome-scale metabolic model testing | Lieven, Christian; Beber, Moritz E.; Olivier, Brett G., et al. | Corrigenda | Acesso aberto |
