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TítuloGenes found in partial sequencing of Phytophthora cinnamomi genome
Outro(s) título(s)Genes descobertos na sequenciação parcial do genoma de Phytophthora cinnamomi
Autor(es)Santos, Luís
Martins, Ivone M.
Maia, Vera
Domínguez, Ángel
Choupina, Altino
Palavras-chaveDNA library
Oomycetes
Phytophthora cinnamomi
tRNA
Biblioteca DNA
Data7-Jul-2016
EditoraSociedade de Ciências Agrárias de Portugal
RevistaRevista de Ciências Agrárias
CitaçãoSantos, L.; Martins, Ivone M.; Maia, V.; Domínguez, A.; Choupina, A., Genes found in partial sequencing of Phytophthora cinnamomi genome. Revista de Ciências Agrárias, 39(3), 431-436, 2016
Resumo(s)Members of the oomycete cause extensive losses in agriculture and widespread degradation in natural plant communities, being responsible for the death of thousands of trees every year. Two of the representative species are Phytophthora infestans, which causes late blight of potato, and Phytophthora cinnamomi, which causes chestnut ink disease, responsible for losses on sweet chestnut production in Europe. Genome sequencing efforts have been focused on the study of three species: P. infestans, P. sojae and P. ramorum. Phytophthora infestans has been developed as the model specie for the genus, possessing excellent genetic and genomics resources including genetic maps, BAC libraries, and EST sequences. Our research team is trying to sequence the genome of P. cinnamomi in order to gain a better understanding of this oomycete, to study changes in plant-pathogen relationships including those resulting from climate change and trying to decrease the pathogens impact on crops and plants in natural ecosystems worldwide. We present here a preliminary report of partially sequenced genomic DNA from P. cinnamomi encoding putative protein-coding sequences and tRNAs. Database analysis reveals the presence of genes conserved in oomycetes.
Os oomicetas causam enormes perdas na agricultura e degradação generalizada em áreas de crescimento natural, sendo responsáveis pela morte de milhares de árvores por ano. Duas das espécies representativas de oomicetas são Phytophthora infestans, que provoca o míldio da batateira, e Phytophthora cinnamomi, que causa a doença da tinta do castanheiro, responsável por perdas de produção de castanha na Europa. Os esforços de sequenciação de genomas de oomicetas têm estado focados no estudo de três espécies: P. infestans, P. sojae e P. ramorum. Phytophthora infestans foi considerada como espécie modelo para o género, pois possui excelentes recursos genéticos e de genómica, incluindo mapas genéticos, bibliotecas BAC, e sequências de EST. Esta equipa de investigadores procura sequenciar o genoma de P. cinnamomi, a fim de obter uma melhor compreensão deste oomiceta, para estudar mudanças nas relações plantapatogénio, incluindo as resultantes das alterações climáticas, e tentando diminuir o impacto do patogénio nas culturas e plantas em ecossistemas naturais em todo o mundo. É apresentada uma abordagem preliminar do DNA genómico parcialmente sequenciado a partir de P. cinnamomi, o qual codifica possíveis sequências de proteínas e tRNAs. As análises em bases de dados revelam a presença de genes conservados em oomicetas.
TipoArtigo
URIhttps://hdl.handle.net/1822/70103
DOI10.19084/RCA16083
ISSN0871-018X
Versão da editorahttp://www.scielo.mec.pt/scielo.php?script=sci_abstract&pid=S0871-018X2016000300012&lng=es&nrm=iso&tlng=en
Arbitragem científicayes
AcessoAcesso aberto
Aparece nas coleções:CEB - Artigos em Revistas Nacionais / Papers in National Journals

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