Processamento de imagens histológicas de cérebros marcados com IHC para estudos neurofisiológicos

Abstract

A curiosidade do ser humano é algo que estará sempre presente no caminho da humanidade, sendo este aspeto que nos faz querer perceber como nós e o mundo que nos rodeia funciona. Com os diferentes estudos e ensaios realizados ao longo dos tempos, foi possível observar que os seres humanos não são tão diferentes de outros animais em diversos aspetos, desta maneira, ao estudar os comportamentos e anatomia destes animais foi possível descobrir e estudar de forma análoga novos aspetos dos seres humanos. Nesta dissertação o foco principal é o cérebro de rato da estripe Wistar e tem como objetivo auxiliar o estudo desta estrutura. Mais especificamente foram usadas dois tipos de imagens: uma de microscopia de secções do cérebro do rato e outra de um atlas que representam esquematicamente as primeiras. De modo a facilitar o processo de análise das imagens de microscopia, esta dissertação explica o desenvolvimento de uma linha de processos capaz de auxiliar esta etapa essencial na realização de qualquer tipo de estudo com as estruturas. O resultado obtido ao executar o método, publicamente disponível num repositório, consiste na sobreposição da representação esquemática de uma parte do cérebro do rato com a imagem de microscopia do tecido que lhe corresponde, o que permite a visualização mais clara dos componentes presentes na imagem original da secção coronal do cérebro de rato, auxiliando no seu estudo.

The human curiosity is something that had always been present in mankind, being this on of the aspects that makes us want to understand ourselves and the world surrounding us. Over the years studies and essays have been written, in which is possible to realize that we are not that difference from other animals in so many levels, thus, through the studies of the anatomy and behavior of these animals, it was possible to find and study new aspects related to the human being. In this thesis the main focus is the rat brain of the Wistar strain and has as the main purpose assist in the study of this. Specifically, 2 different types of images will be used: microscopy from a section of the rat brain and its schematical representation from an atlas. In order to ease the process of microscopy image analysis, throughout this thesis is explained the development of a pipeline of processes capable of assisting in this crucial step of any kind of study with these structures. The outcome accomplished through this pipeline processes, publicly available in a repository, consist of the overlapping of the schematical representation of the section of the rat brain and the related microscopy image of the tissue, allowing a clearer way to analyze the different components of the source image of a rat brain coronary section, supporting its study.